在日常的税务操作中，企业经常会遇到需要对已认证的增值税专用发票进行红冲的情况。这种情况通常发生在发票开具错误、退货、或者交易取消等情形下。那么，对于已经由对方认证的增值税专用发票，应该如何正确地进行红冲处理呢？以下将详细说明相关流程与注意事项。

首先，需要明确的是，“红冲”是指对已开具并被对方认证的增值税专用发票进行作废或更正的操作。由于该发票已经被对方确认，因此不能直接作废，而需通过“红字发票信息表”的方式来进行处理。

具体步骤如下：

1. 填写《红字增值税专用发票信息表》

企业在发生需要红冲的情形后，应先登录增值税发票管理系统，进入“红字发票信息表”模块，根据实际情况填写相关信息。包括原发票代码、号码、金额、税额等内容，并注明红冲原因。系统会自动生成一个《红字发票信息表》，并生成一个唯一的编号。

2. 上传至税务系统

填写完成后，需将《红字发票信息表》上传至主管税务机关的电子税务局系统。税务机关审核通过后，系统会生成一条“红字发票信息表编号”，作为后续开票的依据。

3. 开具红字发票

在获得红字发票信息表编号后，企业可以在增值税发票管理系统中开具红字增值税专用发票。此时，系统会自动校验信息是否匹配，确保红冲操作的准确性。

4. 通知对方单位

红冲完成后，企业应将红字发票及时传递给对方单位，并提醒对方进行相应的账务调整和抵扣处理。同时，双方应保留好相关的纸质或电子凭证，以备日后核查。

需要注意的是，红冲操作必须在规定的时间范围内完成。一般情况下，红字发票应在原发票开具之日起180日内开具，超过期限可能无法进行红冲处理。

此外，企业在进行红冲操作时，还应注意以下几点：

- 确保红冲原因真实、合法，不得虚构或恶意操作。

- 红冲后的发票金额应与原发票一致，不得随意更改。

- 对于涉及跨期业务的红冲，应提前与税务机关沟通，避免产生不必要的税务风险。

总之，对于已由对方认证的增值税专用发票，红冲是一项较为复杂但必要的税务操作。企业应严格按照相关规定执行，确保整个流程的合规性与准确性，从而有效规避潜在的税务问题。